-
بررسی تمایل مجاورت اسیدهای آمینه با یکدیگر در مارپیچهای آلفا
جزئیات بیشتر مقاله- تاریخ ارائه: 1387/01/01
- تاریخ انتشار در تی پی بین: 1387/01/01
- تعداد بازدید: 681
- تعداد پرسش و پاسخ ها: 0
- شماره تماس دبیرخانه رویداد: -
به منظور بررسی تمایل اسیدهای آمینه مجاور (دوتایی) در ساختمانهای دوم از نوع مارپیچ آلفا، مکانهای مورد مطالعه در مارپیچ آلفا بدین شکل انتخاب شدند:n,, ncap, n1, n2, n3, n4, m, c4, c3, c2, c1, ccap, c, در این مکانها توالی های دوتایی مورد بررسی عبارت بودند از: n,ncap, ncap n1, n1n2, n2n3, n3n4, m1m2, m2m3, c4c3, c2c1, c1ccap, ccapc,. ترجیح قرار گرفتن هر اسید آمینه در هر جایگاه مارپیچ آلفا و ترجیح قرار گرفتن 400 توالی دوتایی در جایگاههای دوتایی مختلف مارپیچ آلفا محاسبه و مقایسه شد. بدین منظور یک بانک اطلاعاتی از مارپیچ آلفا با 3705 مارپیچ طراحی شد و مورد استفاده قرار گرفت. در این بانک مارپیچها حداقل دارای 7 اسید آمینه بوده و از مجموعه 696 پروتئین با تشابه کمتر از 25% تشکیل شده بودند. single local propensity(slp) برای همه 20 اسید آمینه در جایگاههای مختلف مارپیچ آلفا محاسبه گردید. علاوه بر این observed doublet local propensity(dlpo) که براساس تکرار اسیدهای آمینه دوتایی استوار است و expected doublet local propensity(dlpe) که بطور مستقیم از روی slp اندازه گیری می شود نیز محاسبه شد. هر گاه ترجیح قرار گرفتن یک جفت اسید آمینه معین در جایگاه دوتایی خاص از مارپیچ آلفا dlpo بیش از ترجیح محاسبه شده توسط حاصل ضرب جایگاههای تکی در مارپیچ آلفا dlpe باشد یا به عبارت دیگر در صورتی که dlpo>>dlpe باشد، این مسئله تمایل 2 اسید آمینه خاص را در مجاورت با یکدیگر در آن جایگاه از مارپیچ آلفا نشان می دهد. نتایج حاصل نشان داد که توالیهای دوتایی که در آنها dlpo>>dlpe می باشد عبارتند از: met-thr در مکان glu-pro, n,ncap در مکان pro-arg, ncapn1 در مکان lys-his, n1n2 در مکان thr-gly, c2c1 در مکان c1ccap و در نهایت gln-pro در مکان ccapc,. علاوه بر این، اسید آمینه gly در مکان ccap با تمایل زیادی همراه اسید آمینه های هیدروفوب در مکان c’ مشاهده می شود. بررسی تمایل مجاورت اسیدهای آمینه در مارپیچهای آلفا، می تواند در طراحی مارپیچهای آلفای جدید موجود در پروتئینها و ایجاد تغییرات مورد نظر در مارپیچهای آلفا مورد استفاده قرار گیرد.
حوزه های تحت پوشش رویداد
مقالات جدیدترین رویدادها
-
استفاده از تحلیل اهمیت-عملکرد در ارائه الگوی مدیریت خلاقیت سازمانی و ارائه راهکار جهت بهبود
-
بررسی تاثیر ارزش وجوه نقد مازاد بر ساختار سرمایه شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی تأثیر سطح افشای ریسک بر قرارداد بدهی شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی تأثیر رتبه بندی اعتباری مبتنی بر مدل امتیاز بازار نوظهور بر نقد شوندگی سهام با تأکید بر خصوصی سازی شرکت ها
-
تأثیر آمیخته بازاریابی پوشاک ایرانی بر تصویر ذهنی مشتری پوشاک ایرانی (هاکوپیان)
-
کاهش اثرات نامطلوب هارمونیکی در سیستم های فتوولتائیک و شبکه های توزیع برق مبتنی بر روش تجزیه و تحلیل دو فازی
-
اهمیت لامسه به هنگام ارتباط با بیمار از دیدگاه پیامبر اعظم (ص)
-
ارزیابی تاثیر رفتار سازمانی مثبت گرا در بهره وری نیروی انسانی (مورد مطالعه سازمان صنعت، معدن و تجارت استان قزوین)
-
اثر عصاره بابونه بر علائم قطع مصرف مرفین در موش سوری
-
مطالعه آزمایشگاهی روی تاثیر الیاف بر مقاومت فشاری بتن های خود تراکم
مقالات جدیدترین ژورنال ها
-
مدیریت و بررسی افسردگی دانش آموزان دختر مقطع متوسطه دوم در دروان کرونا در شهرستان دزفول
-
مدیریت و بررسی خرد سیاسی در اندیشه ی فردوسی در ادب ایران
-
واکاوی و مدیریت توصیفی قلمدان(جاکلیدی)ضریح در موزه آستان قدس رضوی
-
بررسی تاثیر خلاقیت، دانش و انگیزه کارکنان بر پیشنهادات نوآورانه کارکنان ( مورد مطالعه: هتل های 3 و 4 ستاره استان کرمان)
-
بررسی تاثیر کیفیت سیستم های اطلاعاتی بر تصمیم گیری موفق در شرکتهای تولیدی استان اصفهان (مورد مطالعه: مدیران شرکتهای تولیدی استان اصفهان)
-
تحلیلی برعملکرد سازمان مدیریت پسماند شهرداری قم در اجرای طرح تفکیک از مبدا پسماند و اهمیت آن از دیدگاه شهروندان با استفاده از تکنیک (ipa)
-
تاثیر استفاده از ترکیب نانو سیلیس و متاکائولن در بتن حاوی لاستیک ریزدانه دانه بازیافتی بر خصوصیات مکانیکی بتن
-
بررسی تأثیر اقدامات مدیریت کیفیت زنجیره تأمین بر عملکرد عملیاتی
-
ساختار افسانه گردانی در شعر آزاد نیما
-
بررسی تاثیر استانداردهای ملی و بین المللی بر کیفیت خدمات هتل ها؛ مطالعه موردی: مدیران عالی و میانی هتل های 4 و 5 ستاره مشهد
سوال خود را در مورد این مقاله مطرح نمایید :