-
طراحی و پیاده سازی الگوریتم ترازبندی چند گانه دنباله ها با استفاده از بلوم فیلتر ماتریسی بر روی gpu
جزئیات بیشتر مقاله- تاریخ ارائه: 1397/04/27
- تاریخ انتشار در تی پی بین: 1397/04/27
- تعداد بازدید: 514
- تعداد پرسش و پاسخ ها: 0
- شماره تماس دبیرخانه رویداد: -
تحقیق حاضر با عنوان «ترازبندی چند گانه توالی با استفاده از بلوم فیلتر ماتریسی» در سال 1397 انجام شده است. رویکردهای جدید برای ترازبندی چندگانه توالی ها، به طور گسترده ای رو به پیشرفت اند. ترازبندی های چندگانه برای چند صد یا حتی چندین هزار توالی، با ابزارهای معروف فعلی مانند clustalw نیازمند زمان زیادی برای انجام محاسبات می باشد. در این پژوهش الگوریتمی ایجاد می شود که به صورت موازی ترازبندی چندگانه ی توالی ها را انجام می دهد و برای اینکار از سیستم خط لوله برای موازی سازی استفاده می کند. بررسی ها نشان می دهند که برای دیتاست بزرگ توالی پروتئین و dna (که برای دانلود در دسترع عموم قرار دارد)، افزایش سرعت چشم گیری در مقایسه با clustalw بدست می آید. این پژوهش به مطالعه ی بلوم فیلتر ها، مساله ی ترازبندی چند گانه توالی و طراحی الگوریتمی برای حل این مساله با استفاده از تکنولوژی gpu می پردازد. همچنین در این پژوهش به معرفی رابط های برنامه نویسی موسومی مانند clustalw و clustalw- mpi پرداخته شده است. نتایج بدست آمده نشان می دهد که برا ی مرحله 1، 2 و 3 افزایش سرعت به ترتیب 91، 36، 74، 18و 27، 11 نسبت به clustalw-mpi می باشد.
مقالات جدیدترین رویدادها
-
استفاده از تحلیل اهمیت-عملکرد در ارائه الگوی مدیریت خلاقیت سازمانی و ارائه راهکار جهت بهبود
-
بررسی تاثیر ارزش وجوه نقد مازاد بر ساختار سرمایه شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی تأثیر سطح افشای ریسک بر قرارداد بدهی شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی تأثیر رتبه بندی اعتباری مبتنی بر مدل امتیاز بازار نوظهور بر نقد شوندگی سهام با تأکید بر خصوصی سازی شرکت ها
-
تأثیر آمیخته بازاریابی پوشاک ایرانی بر تصویر ذهنی مشتری پوشاک ایرانی (هاکوپیان)
-
بررسی رابطه بین هوش هیجانی با میزان سلامت روان کارکنان ورزشکار و غیر ورزشکار اداره اموزش و پرورش شهرستان لاهیجان
-
بررسی آزمایشگاهی تأثیر دما در عملکرد سیال حفاری پایه-آبی گلایکولی در کاهش تورم نمونه های شیلی
-
مدیریت ریسک و نقش فناوری اطلاعات در شرکت بیمه دی
-
اثر یک وهله فعالیت هوازی با شدت متوسط بر تعادل آنابولیکی به کاتابولیکی در اوقات مختلف شبانه روز در مردان میانسال غیرفعال
-
بررسی تاثیر پوکه ی آتش فشان و متاکائولن بر مقاومت فشاری بتن
مقالات جدیدترین ژورنال ها
-
مدیریت و بررسی افسردگی دانش آموزان دختر مقطع متوسطه دوم در دروان کرونا در شهرستان دزفول
-
مدیریت و بررسی خرد سیاسی در اندیشه ی فردوسی در ادب ایران
-
واکاوی و مدیریت توصیفی قلمدان(جاکلیدی)ضریح در موزه آستان قدس رضوی
-
بررسی تاثیر خلاقیت، دانش و انگیزه کارکنان بر پیشنهادات نوآورانه کارکنان ( مورد مطالعه: هتل های 3 و 4 ستاره استان کرمان)
-
بررسی تاثیر کیفیت سیستم های اطلاعاتی بر تصمیم گیری موفق در شرکتهای تولیدی استان اصفهان (مورد مطالعه: مدیران شرکتهای تولیدی استان اصفهان)
-
اثر ویژگی های گیمیفیکیشن بر ارزش ویژه برند: نقش تعامل برند
-
بررسی تأثیر عوامل رشد تولید ناخالص داخلی بر ساختار سرمایه شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران
-
بررسی و تاثیر تربیت خانوادگی دانش آموز و نوع رفتار والدین با وی و اثرات آن بر پیشرفت تحصیلی آن ها
-
effect of non-uniform temperature distribution on entropy generation and enthalpy for the laminar developing pipe flow of a high prandtl number fluid
-
effect of mineral pitch and zycosil nano-material on mechanical properties and moisture susceptibility of asphalt mixtures
سوال خود را در مورد این مقاله مطرح نمایید :