تشخیص سریع مایکوباکتریوم های آتیپیک در بیماران با علایم سل ریوی: ارزیابی لوکوس (qub 3232 (590bp با روش vntr

زمینه و هدف: با توجه به انتشار جهانی مایکوباکتریوم های آتیپیک، شناسایی و تشخیص این نوع مایکوباکتریوم ها از اهمیت ویژه ای برخوردار است. اخیراً مطالعات مولکولی انجام شده با استفاده از روش های انگشت نگاری ژنتیکی که پرهزینه و وقت گیر است، لوکوس های اختصاصی مربوط به مایکوباکتریوم ها را شناسایی کرده است. در این مطالعه علاوه بر روش hsp65 pcr-rflp، لوکوس qub 3232 (590bp) با استفاده از روش توالی های تکراری پشت سرهم (vntr) برای تمایز مایکوباکتریوم های آتیپیک از مایکوباکتریوم توبرکلوزیس کمپلکس مورد بررسی قرار گرفت.

روش بررسی: این بررسی بر روی 371 نمونه ی ریوی و خارج جدا شده از بیماران با علائم سل ریوی انجام شد. بعد از جداسازی و کشت این نمونه ها با استفاده از محیط lj، تست های افتراقی شامل احیای نیترات، آزمایش فعالیت کاتالاز، آزمایش نیاسین، سرعت رشد و تولید پیگمان انجام شد. سپس حساسیت دارویی با روش نسبی صورت گرفت. dna به روش فنل- کلروفرم استخراج و قطعه ی hsp65 توسط pcr تکثیر یافت. قطعات تکثیر یافته توسط آنزیم های hphi, avaii, hpaii هضم و الگوی بدست آمده، روی اگارز 3 درصد الکتروفورز شد. همچنین لوکوس  qub 3232 (590bp)استفاده از روش vntr در نمونه های مایکوباکتریوم های آتیپیک و توبرکلوزیس کمپلکس مورد بررسی و مقایسه قرار گرفت. یافته ها: از مجموع 371 نمونه، 32 نمونه (8.6 درصد) مقاوم به دارو 184 ,(mdr) نمونه (49.5 درصد) حساس و 155 نمونه (41 درصد) غیر mdr گزارش شدند که 15 درصد از نمونه های mdr و 22 درصد از نمونه های غیر  mdrمربوط به مایکوباکتریوم های آتیپیک بودند. از مجموع 43 نمونه ی آتیپیک، 12 نمونه، سریع الرشد (27.9 درصد) و بقیه، کند رشد (72.1 درصد) بودند. از میان کند رشدها، 58 درصد مایکوباکتریوم سیمیه و 19 درصد مایکوباکتریوم کانزاسی جدا گردید. لوکوس qub3232 با حساسیتی برابر 80 درصد توانست مایکوباکتریوم های آتیپیک و توبرکلوزیس کمپلکس را از یکدگیر تمایز دهد. نتیجه گیری: لوکوس qub3232 دارای قدرت افتراق بالایی بین مایکوباکتریوم های آتیپیک و تیپیک می باشد. بنابراین می توان به جای pcr-rflp، لوکوس qub3232 را با استفاده از روش vntr برای تمایز این دو دسته مورد استفاده قرار داد.